Description

Leader of the group Computational Imaging: Joost Batenburg.

Our research group is developing the next generation of 3D imaging – enabling scientists to look further into objects of all kinds. Based on mathematics, algorithms and numerical solution techniques, our approach is interdisciplinary, combining aspects of mathematics, computer science and physics. We pride ourselves on the versatility of our solutions, and our algorithms can be applied to a wide range of imaging in science, medicine and industry. In Computational Imaging, it’s our goal to constantly push the boundaries of research. By combining advanced image acquisition, parameter estimation, and discrete tomography algorithms for example, we are able to develop workflows for 3D electron microscopy at atomic resolution.

 

News

The Netherlands’ smallest supercomputer is here

The Netherlands’ smallest supercomputer is here

A team of Dutch scientists has built a supercomputer the size of four pizza boxes. The Little Green Machine II has the computing power of 10,000 PCs and will be used by researchers in oceanography, computer science, artificial intelligence, financial modeling and astronomy. CWI researchers Joost Batenburg and Kees Oosterlee, who were part of the development team, will use the machine for computational imaging and machine learning for time series respectively. The computer is based at Leiden University (the Netherlands) and developed with help from IBM.

The Netherlands’ smallest supercomputer is here - Read More…

Events

PhD Defense Linda Plantagie (Computational Imaging)

  • 2017-04-13T13:45:00+02:00
  • 2017-04-13T15:00:00+02:00
April 13 Thursday

Start: 2017-04-13 13:45:00+02:00 End: 2017-04-13 15:00:00+02:00

Leiden (Academiegebouw, Rapenburg 73)

Everyone is invited to atttend the public defense of Linda Plantagie of her PhD thesis:

Algebraic filters for Filtered Backprojection

Promotor: Prof. dr. K. J. Batenburg

 

Computed Tomography (CT) is een techniek waarmee een beeld gemaakt kan worden van het inwendige van een object zonder het open te maken. Dit beeld wordt met behulp van een wiskundig algoritme gereconstrueerd uit een aantal röntgenfoto’s die onder verschillende hoeken zijn opgenomen. Een bekende toepassing is medische beeldvorming met behulp van een CT-scanner. Er zijn op hoofdlijnen twee klassen algoritmen te onderscheiden om deze afbeeldingen te berekenen, elk met specifieke voor- en nadelen. Een bekend algoritme in de eerste klasse is Filtered Backprojection (FBP), waarmee met lage rekenintensiteit beelden worden berekend. Algoritmen uit de tweede klasse, algebraische reconstructiemethoden (ARM) genaamd, staan bekend om hun stabiliteit bij data met veel ruis, en relatief goede beeldvorming bij weinig hoeken of beperkt hoekbereik waaronder gescand kan worden. In dit proefschrift wordt het nieuwe algoritme Algebraic filter - Filtered Backprojection (AF-FBP) geïntroduceerd waarmee een brug wordt gemaakt tussen deze twee klassen en de voordelen van beide zo goed mogelijk worden benut. Met behulp van zowel gesimuleerde als experimentele onderzoeksdata wordt aangetoond dat met de relatief lage rekenintensiteit van FBP beelden kunnen worden berekend die kwalitief gezien de beelden van lineaire ARMs en van een subklasse van de niet-lineaire ARMs benaderen. Wanneer er vaak met eenzelfde scanopstelling wordt gewerkt is het met AF-FBP mogelijk om snel relatief goede beelden te berekenen met FBP bij weinig gescande hoeken, bij een beperkt hoekbereik, of bij data met veel ruis.

PhD Defence Daniël Pelt (Computational Imaging)

  • 2016-05-03T14:15:00+02:00
  • 2016-05-03T15:15:00+02:00
May 3 Tuesday

Start: 2016-05-03 14:15:00+02:00 End: 2016-05-03 15:15:00+02:00

Senate Room of the Academy Building of the Leiden University, Rapenburg 73

Everybody is cordially invited to attend the public defence of the PhD thesis of Daniël Pelt.

The dissertation title is: "Filter-based reconstruction methods for tomography".

Promotor: Prof. dr. Joost Batenburg (CWI, CI / Leiden University).

 

More information:
Faster computation of high-quality 3D images

Members of Computational Imaging

Publications

Software

Current Projects

  • Meyn Food Processing
  • Real-Time 3D Tomography
  • The See-Through Museum
  • Three-Dimensional Reconstruction of Biological Specimen with Scanning Electron Microscopy
  • AMTIC
    Automated multi-modal tomography for sub-22nm IC nodes
  • VOXEL
    Volumetric medical x-ray imaging at extremely low dose

Partners

  • Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Gif-sur-Yvette, France
  • CNR Pisa
  • COMMISSARIAT A L ENERGIE ATOMIQUE ET AUX ENERGIES ALTERNATIVES
  • IMAGINE OPTIC
  • Meyn Food Processing Technology B.V.
  • Universidad Politécnica de Madrid
  • FEI
  • IMEC
  • Technische Universiteit Delft